毕业论文万方检测系统是一种通过比对文本相似度的方式来检测学术论文的工具。其原理是将待检测的论文与万方数据库中的文献进行比对，通过算法计算相似度，从而判断论文是否存在抄袭行为。对于学术惩罚，通常是根据检测结果来进行相应的处理，比如撤销学位、禁止发表等。

毕业论文万方检测系统检测与学术惩罚是为了维护学术界的学术规范和学术诚信，防止学术不端行为的发生。通过系统的检测，可以有效地发现抄袭现象，保障学术成果的真实性和原创性。学术惩罚则是对于抄袭等学术不端行为的一种惩罚措施，有助于提高学术界的整体素质和水平。